Pod vedením pedagoga v ateliéru probíhá hlavní náplň studia. Ateliér je v tomto pokročilém magisterském programu především prostředím, které umožňuje studentovi rozvinout vlastní kreativní potenciál. Student má možnost se v ateliérech, v dialogu, konfrontovat s vedoucími architektonických ateliérů, osobnostmi české architektury. Student si vybírá jak vedoucího pedagoga, tak ateliérové zadání pro daný semestr.