Cílem předmětu je seznámit studenty se složením (biotická a abiotická složka), vlastnostmi, typy a funkcemi sladkovodních ekosystémů, okrajově i s mořskou hydrobiologií. Vztahy organismů k prostředí a na vztahy mezi organismy navzájem. Charakteristika stojatých vod (jezera, přehradní nádrže, rybníky, aj.) i tekoucích vod (potoky, řeky) a základní charakteristika typických nebo ekologicky významných organismů, kteří obývají jednotlivé biotopy. Další informace budou o aplikované limnologii se zaměřením na problémy znečištění vody (acidifikace a eutrofizace, civilizační specifické polutanty ve vodách, vodní květ, aj.). Studenti se seznámí se základními hydrobiologickými metodami, které si osvojí při praktických cvičeních v terénu.